National Science Library, Chinese Academy of Sciences
  登录 机构网站 ENGLISH
您当前的位置是: 首页-> 详细浏览
服务链接:
作者 : 吴高银 ;  
答辩时间 : 2016-05-01
论文类型 : 工程硕士专业学位
学位授予单位 : 中国科学院研究生院
论文总页码 : 55
中文关键词 : 富勒烯;;石墨烯;;TNF-a;;细胞色素c
英文关键词 : fullerene, graphene, TNF-a, cytochrome c
中文摘要 : 近几年,随着纳米科技的发展,纳米技术在人们生活中的应用越来越广泛,纳米材料在生物、化学领域具有广泛的应用。碳纳米材料作为纳米材料的一种,以其独特的物理化学性质,在很多领域具有很多成功的应用,尤其是在生物医学及材料化学方面,如富勒烯及石墨烯衍生物材料可以很好的抑制肿瘤细胞的扩散。但是富勒烯材料的抗肿瘤机制仍不清楚。为了在分子层面研究碳纳米材料对肿瘤细胞扩散的抑制作用,我们对碳纳米材料与生物大分子的复合物进行了分子动力学模拟的研究。主要分为两部分:一是研究了富勒烯及其羟基衍生物与肿瘤坏死因子(TNF-a)相互作用机制,并基于此进行了药物设计;二是研究了石墨烯氧化物与细胞色素c的相互作用机制。富勒烯及其羟基衍生物与TNF-a的相互作用机制研究通过对富勒烯及其衍生物与TNF-a相互作用的分子模拟研究,我们发现富勒烯及其羟基衍生物与TNF-a的结合位点与之前报道的小分子抑制剂SPD304与TNF-a的结合位点是非常相似的,都结合与TNF-a二聚体中间的结合位点内。而且通过结合自由能的计算我们发现几种碳纳米材料C60 , C60(OH)12, Gd@C60, C82, C82(OH)12, Gd@C82, Gd@C82(OH)13 和 Gd@C82(OH)21 都比之前报道的三个小分子具有更好的结合能力,是潜在的更好的TNF-a的抑制剂。石墨烯氧化物与细胞色素c的相互作用机制研究通过对石墨烯及其氧化物与细胞色素c相互作用机制的研究,我们发现石墨烯氧化物与细胞色素c分子之间存在较强的相互作用,且随着石墨烯氧化程度的增加,他们之间的相互作用越强。而且通过固定石墨烯氧化物分子的分子模拟研究,我们发现石墨烯分子对细胞色素c分子产生一定的影响,可以改变细胞色素c分子的结构。通过对双层的石墨烯氧化物分子与细胞色素c分子相互作用的研究,我们发现细胞色素c中的无规则卷曲结构与石墨烯氧化物分子之间存在较强的相互作用。这说明石墨烯氧化物能够对细胞色素c的结构产生影响,且无规则卷曲结构在他们的相互作用中是起主要作用的。
英文摘要 : In recent years, with the development of nano-science and nanotechnology, the application of nano technology in people's life becomes more and more popular, nano materials have extensive applications in the field of biology and chemistry. Carbon nano-materials, with thire unique physical and chemical properties, have many successful applications in many fields, especially in the biomedical and material chemistry fields. For example, fullerenes and graphene derivatives can well inhibit the proliferation of tumor cells. However, the molecular-level mechanisms of the anti-tumor activity are still unknown. Therefore, we studied the interaction mechanism between carbon nano-materials and biological macromolecules using the molecular dynamics simulation. The study has two parts. The first part is the interaction of fullerenes and thire hydroxyl derivatives with tumor necrosis factor (TNF-a) and the further rational drug design based on these calculations. The secondpart is the interaction between graphene oxide and cytochrome c.1 The interaction between TNF-a and fullerene or fullerene derivatives Based on molecular dynamics simulation of the interaction between fullerenes and their derivatives with TNF-a, we found that these materials’ binding sites with TNF-a were similar to small molecule inhibitors SPD304 that was previously reported. All were combined in the middle of the binding site of the TNF-a dimer. By the calculation of binding free energy, we found several kinds of carbon nanomaterials C60, C60 (OH) 12, Gd@C60, C82, C82 (OH)12, Gd@C82, Gd@C82(OH)13 and Gd@C82(OH)21 have better inhibiting ability with the TNF-a than the previously reported small molecules. 2 Graphene or its oxide interacting with cytochrome CThrough studying the interaction mechanism between graphene or graphene oxide with cytochrome c, we found that graphene oxide and cytochrome c have strong interaction. The increase of graphene’s oxidation degree of enhances the interaction between them. Through molecular dynamics simulation with the grapheme oxide fixed, we found that graphene oxidation could change the structure of cytochrome c. Through studying the interaction mechanism between double-layer graphene oxide with cytochrome c, we found that the random coil structure of cytochrome c had a stronger interaction with graphene oxide. The above result suggests that graphene oxide has strong influence on the structure of cytochrome c; and that random coil structure plays a main role in their interaction.

相关文献推荐:

专利制度和财税政策对企业研发选煤和产业发展的影响分析:一个基于自主体学位论文

作者:刘涛著等 答辩时间:2007-6-6  

专利制度和财税政策对企业研发选煤和产业发展的影响分析:一个基于自主体学位论文

作者:刘涛著等 培养单位:[科技政策与管理科学研究所]  答辩时间:2007-6-6  

面向自主创新能力建设的高技术产业知识产权战略研究学位论文

作者:宋河发著等 答辩时间:2007-6-16  

面向自主创新能力建设的高技术产业知识产权战略研究学位论文

作者:宋河发著等 培养单位:[科技政策与管理科学研究所]  答辩时间:2007-6-16  

自然资源与社会经济发展:经济发展不同阶段与主要资源消费研究学位论文

作者:刘燕鹏等 培养单位:[中国科学院生态环境研究中心]  答辩时间:1998  总页码:40  

基于自主开发和商用RSoft软件的光子晶体模拟研究和器件设计学位论文

作者:江斌等 培养单位:[半导体研究所]  答辩时间:2012  

基于双向星间链路的自主时间同步仿真分析学位论文

作者:方 琳等 培养单位:[国家授时中心]  答辩时间:2013-5  

初中生完美主义发展及其与自尊的关系学位论文

作者:王龙等 培养单位:[中国科学院研究生院]  答辩时间:2011-5-16  总页码:34  

基于自主开发和商用RSoft软件的光子晶体模拟研究和器件设计学位论文

作者:江斌等 培养单位:[中国科学院研究生院]  答辩时间:2012-6-2  

全球价值链背景下我国高新技术企业自主品牌发展研究学位论文

作者:黃贵蓮等 培养单位:[中国科学院科技政策与管理科学研究所]  答辩时间:2008  总页码:58  

问图书管理员更多图书管理员

学科咨询馆员
学科馆员

电话:
邮件:
问图书馆员

图标说明

在线获取原文 原文传递 详细信息 图书在架状态 图书馆际互借 问图书馆员

常见问题

图书馆开放时间 图书馆位置 借阅要求 您在使用中发现的任何错误,都可以向我们 【报告错误】,非常感谢!

作者信息:×